A través de nueve salas se adquiere una visión del mundo andino y de los Valles Orientales, considerando tanto aspectos materiales como simbólicos de los pueblos originarios del área.A través de nueve salas se adquiere una visión del mundo andino y de los Valles Orientales, considerando tanto aspectos materiales como simbólicos de los pueblos originarios del área.

Llama particularmente la atención el montaje que permite tener un panorama de sus prácticas funerarias, en vitrinas que replican el ambiente donde se hallaron las distintas momias. Por último, una sala de Exposiciones Temporarias destaca los avances de las investigaciones en curso.